143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1075 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1075  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  43.55 
 
 
252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  43.85 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.04 
 
 
256 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.56 
 
 
286 aa  197  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.26 
 
 
241 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1892  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.86 
 
 
296 aa  191  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.68 
 
 
297 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  39.73 
 
 
334 aa  181  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  36.54 
 
 
285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2333  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.99 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2692  twin-arginine translocation pathway signal  38.84 
 
 
300 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  37.35 
 
 
250 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  37.75 
 
 
250 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0334  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.52 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212034  normal  0.78899 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  37.11 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  39.15 
 
 
290 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.58 
 
 
294 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1198  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.08 
 
 
255 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3435  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.94 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0527  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.94 
 
 
289 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820487  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.02 
 
 
292 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.89 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  34.02 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.05 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.62 
 
 
287 aa  138  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.49 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.19 
 
 
245 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.88 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4611  xylose isomerase domain-containing protein  31.18 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0365  xylose isomerase domain-containing protein  32.41 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.92 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1158  xylose isomerase-like TIM barrel  32.41 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.3 
 
 
243 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  31.02 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.04 
 
 
283 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  28.94 
 
 
304 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.86 
 
 
281 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  28.96 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.72 
 
 
284 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1628  xylose isomerase domain-containing protein  29.88 
 
 
319 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3701  hypothetical protein  33.19 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  29.32 
 
 
326 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2705  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.917825  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.85 
 
 
278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0425  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.91 
 
 
243 aa  108  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  28.04 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4324  xylose isomerase domain-containing protein  28.14 
 
 
309 aa  105  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1723  xylose isomerase domain-containing protein  27.73 
 
 
253 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1595  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.27 
 
 
284 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3458  xylose isomerase domain-containing protein  28.51 
 
 
248 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0886  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.490019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.04 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1739  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.4 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.125041  normal  0.800521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  34.74 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5339  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.81 
 
 
250 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00377604  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3722  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.64 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0088  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.72 
 
 
341 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20260  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.8 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.86 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27510  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.02 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2406  hypothetical protein  24.89 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.23 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.44 
 
 
251 aa  82  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.843177  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.75 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446343  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  26 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.63 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.64 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.04 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  26.54 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.38 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22460  sugar phosphate isomerase/epimerase  21.36 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  24.31 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.1 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2541  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.71 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  32.05 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.9 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.06 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  26.12 
 
 
310 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  22.54 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  24.6 
 
 
298 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.33 
 
 
308 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  23.36 
 
 
303 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  23.81 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  25.53 
 
 
301 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  26.27 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  24.6 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 
305 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  24.21 
 
 
298 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  23.05 
 
 
298 aa  55.5  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  28.05 
 
 
371 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  23.4 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  23.4 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  23.4 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  23.4 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  23.4 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  28.39 
 
 
303 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  28.85 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  23.05 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>