110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0784 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1595  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.48 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20260  sugar phosphate isomerase/epimerase  45 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239255  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22460  sugar phosphate isomerase/epimerase  41.88 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2333  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.65 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  30.15 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1075  xylose isomerase domain-containing protein  28.85 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  29.62 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.88 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.24 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.65 
 
 		 297 aa  99.4  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1892  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.26 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.92 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.25 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  29.72 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.75 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.17 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.8 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.17 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.69 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2705  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.05 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.917825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.42 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.56 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.44 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.98 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  31.91 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  31.94 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4324  xylose isomerase domain-containing protein  30.05 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.37 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1628  xylose isomerase domain-containing protein  24.72 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0425  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.74 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1723  xylose isomerase domain-containing protein  27.57 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  24.43 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.01 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.61 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.42 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4611  xylose isomerase domain-containing protein  26.18 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2692  twin-arginine translocation pathway signal  24.48 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  26.84 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0334  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.53 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212034  normal  0.78899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0527  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.87 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3435  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.7 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  32.77 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  25 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3458  xylose isomerase domain-containing protein  28.28 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1198  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1158  xylose isomerase-like TIM barrel  25.51 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0365  xylose isomerase domain-containing protein  27.87 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.08 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446343  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1739  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.3 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.125041  normal  0.800521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.51 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5339  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.24 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00377604  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2406  hypothetical protein  30.77 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.38 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0886  xylose isomerase domain-containing protein  30.58 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.490019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27510  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.41 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  24.44 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.47 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.18 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.39 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  24.89 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3701  hypothetical protein  25.31 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2541  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.19 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  29.37 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  36.99 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  27.59 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  27.59 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  27.59 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  27.59 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  27.59 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  27.59 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  27.59 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  26.19 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.6 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3722  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  26.9 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  29.8 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.59 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.21 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  27.56 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0088  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.84 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  29.14 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  29.14 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  28.74 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.69 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  27.94 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.45 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  29.85 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  24.09 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.36 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.13 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.86 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.843177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  23.91 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3140  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.04 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  20.93 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>