105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11160 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  100 
 
 		 275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  35.64 
 
 		 334 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.71 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.69 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2692  twin-arginine translocation pathway signal  32.92 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1892  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.15 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1075  xylose isomerase domain-containing protein  34.02 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  34.17 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3458  xylose isomerase domain-containing protein  34.94 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.55 
 
 		 294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.31 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4611  xylose isomerase domain-containing protein  32.23 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.27 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3435  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.12 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  33.75 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.45 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1723  xylose isomerase domain-containing protein  34.73 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.43 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  32.5 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.35 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0527  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  33.46 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.47 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.21 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0334  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.66 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212034  normal  0.78899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  33.19 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1628  xylose isomerase domain-containing protein  28.12 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  27.14 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  32.77 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1198  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.91 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2333  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.1 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  26.77 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  29.44 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.51 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.23 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1158  xylose isomerase-like TIM barrel  32.53 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  30.47 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.26 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0365  xylose isomerase domain-containing protein  28.69 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.38 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446343  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2406  hypothetical protein  33.61 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4324  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0886  xylose isomerase domain-containing protein  28.94 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.490019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2705  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.917825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.52 
 
 		 324 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  36.07 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.86 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.94 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3701  hypothetical protein  29.46 
 
 		 259 aa  85.5  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.58 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0088  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.48 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.43 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5339  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.04 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00377604  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3722  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.46 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.1 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  34.17 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27510  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.07 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1739  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.18 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.125041  normal  0.800521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.63 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.2 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  31.89 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.97 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.843177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1595  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0425  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.85 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.41 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20260  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.15 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239255  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22460  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.72 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 		 924 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.39 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  25.18 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  24.31 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  24.31 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  24.31 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  24.31 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  24.31 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  24.66 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  24.66 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.78 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2541  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.86 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.82 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  27.61 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  25.62 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.03 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  25.45 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  25.57 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  26.99 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  25.45 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  25.45 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  23.77 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  25.78 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  22.78 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.46 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  24.18 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  26.71 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  24.28 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2490  xylose isomerase domain-containing protein  32.61 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00709656 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>