122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1695 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  100 
 
 
285 aa  594  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.93 
 
 
286 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.04 
 
 
297 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1075  xylose isomerase domain-containing protein  36.54 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1892  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.02 
 
 
256 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  36.86 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  36.05 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  32.62 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.72 
 
 
294 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  32.31 
 
 
290 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.97 
 
 
324 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2692  twin-arginine translocation pathway signal  32.82 
 
 
300 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.83 
 
 
292 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3435  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.77 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.12 
 
 
279 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0334  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.93 
 
 
318 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212034  normal  0.78899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0527  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.43 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820487  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.96 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1628  xylose isomerase domain-containing protein  31.13 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2705  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.63 
 
 
287 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.917825  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.06 
 
 
241 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  33.96 
 
 
326 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.93 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  29 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.5 
 
 
284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.91 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0088  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.57 
 
 
341 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4611  xylose isomerase domain-containing protein  32.82 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  30.36 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2333  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.17 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.56 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  29.04 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3722  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.66 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27510  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.84 
 
 
274 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3458  xylose isomerase domain-containing protein  27.78 
 
 
248 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.44 
 
 
275 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.34 
 
 
245 aa  102  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.6 
 
 
248 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 
254 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2406  hypothetical protein  28.1 
 
 
253 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.63 
 
 
287 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2541  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.86 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1723  xylose isomerase domain-containing protein  27.39 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.63 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20260  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.24 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4324  xylose isomerase domain-containing protein  29.23 
 
 
309 aa  95.5  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.62 
 
 
248 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0886  xylose isomerase domain-containing protein  26.07 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.490019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.72 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.63 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.06 
 
 
253 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.88 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446343  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1198  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.17 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5339  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.62 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00377604  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  27.15 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0425  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.03 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.31 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1595  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.71 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  27.02 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1158  xylose isomerase-like TIM barrel  23.86 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  27.02 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0365  xylose isomerase domain-containing protein  24.37 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  25.1 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.7 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.65 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  26.54 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.46 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3701  hypothetical protein  23.55 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22460  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.4 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.14 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  24.43 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  26.38 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1739  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.72 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.125041  normal  0.800521 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  24.35 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  24.43 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  25.16 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  25.16 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.22 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  24.1 
 
 
309 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  24.1 
 
 
309 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.21 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  26.84 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  24.43 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  26 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.843177  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  23.83 
 
 
308 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  24.16 
 
 
310 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  27.61 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  23.33 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.11 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 
300 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  23.05 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.26 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  23.05 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  23.05 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  23.05 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  23.05 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  26.97 
 
 
294 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>