89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00428 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 334 aa  694    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2692  twin-arginine translocation pathway signal  56.94 
 
 		 300 aa  348  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.96 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.61 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.67 
 
 		 294 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1892  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.69 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  38.87 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.88 
 
 		 292 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1075  xylose isomerase domain-containing protein  39.73 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  35.29 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.35 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  37.55 
 
 		 250 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.96 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  37.12 
 
 		 252 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0334  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.09 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212034  normal  0.78899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  32.62 
 
 		 285 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.22 
 
 		 241 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.2 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.4 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  30.89 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.98 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.84 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.45 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1628  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  33.58 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.03 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  31.23 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.2 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  31.75 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3435  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.5 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.83 
 
 		 284 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2333  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.49 
 
 		 255 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.95 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4611  xylose isomerase domain-containing protein  32.28 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2705  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.84 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.917825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0527  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.21 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1723  xylose isomerase domain-containing protein  32.08 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.74 
 
 		 287 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3458  xylose isomerase domain-containing protein  31.47 
 
 		 248 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  30.16 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0425  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.67 
 
 		 243 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4324  xylose isomerase domain-containing protein  30.32 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0088  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.96 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  25.94 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.17 
 
 		 243 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2406  hypothetical protein  32.5 
 
 		 253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  31.91 
 
 		 258 aa  109  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0886  xylose isomerase domain-containing protein  27.78 
 
 		 254 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.490019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0365  xylose isomerase domain-containing protein  31.12 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.24 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.3 
 
 		 248 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1158  xylose isomerase-like TIM barrel  29.46 
 
 		 253 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.11 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446343  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  32.86 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1198  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.09 
 
 		 255 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  35.68 
 
 		 254 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.96 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1595  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.99 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  29.07 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.16 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.87 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3722  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.96 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3701  hypothetical protein  26.58 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20260  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.22 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239255  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1739  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.21 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.125041  normal  0.800521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.843177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5339  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.91 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00377604  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27510  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.86 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2541  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.99 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22460  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.24 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.43 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  22.58 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  29.6 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  25.48 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  27.34 
 
 		 237 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  27.34 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  22.58 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  26.56 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.31 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.7 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  25.78 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.94 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  25.78 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.88 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.11 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  27.78 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  22.89 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>