139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4611 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4611  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  658    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  50.33 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.99 
 
 		 294 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.85 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1892  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.44 
 
 		 296 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  34.03 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.28 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.44 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.13 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.36 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  33.45 
 
 		 250 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  33.09 
 
 		 252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.23 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1075  xylose isomerase domain-containing protein  31.18 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2692  twin-arginine translocation pathway signal  32.54 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2705  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.69 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.917825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0527  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.87 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  31.85 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  31.39 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.86 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0088  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.12 
 
 		 341 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.35 
 
 		 287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0334  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.24 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212034  normal  0.78899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  30.66 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.41 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.96 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1628  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.58 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3435  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.74 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.18 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  33.7 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.69 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.04 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4324  xylose isomerase domain-containing protein  31.48 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  27.82 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  27.47 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2333  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.17 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  29.33 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1198  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.64 
 
 		 255 aa  97.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1158  xylose isomerase-like TIM barrel  30.22 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3722  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.24 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27510  sugar phosphate isomerase/epimerase  33.78 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0365  xylose isomerase domain-containing protein  30.19 
 
 		 284 aa  86.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3458  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.94 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  26.78 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3701  hypothetical protein  29.01 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  31.95 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.41 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1723  xylose isomerase domain-containing protein  27.92 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22460  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.16 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.89 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446343  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.5 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5339  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00377604  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2406  hypothetical protein  29.52 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0886  xylose isomerase domain-containing protein  26.97 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.490019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2541  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.12 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.22 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.96 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.49 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.18 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.3 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0425  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.35 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.31 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1595  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20260  sugar phosphate isomerase/epimerase  26 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  26.77 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  26.49 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  23.34 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  26.12 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  23.34 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  26.39 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  25.56 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  26.39 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  26.39 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  23.43 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  27.96 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  26.02 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  23.49 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  25.4 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  25.19 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  25.79 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  23.49 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.93 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.843177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  25.58 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1739  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.4 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.125041  normal  0.800521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  26.44 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  23.64 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  26.81 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  25.48 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.35 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.35 
 
 		 924 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  25.24 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  24.73 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  24.91 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.42 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>