21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3328 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3328  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 346 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0286  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.2 
 
 		 335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1896  xylose isomerase domain-containing protein  34.6 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4669  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.68 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104946  hitchhiker  0.000000014237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.93 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  26.53 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.54 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.64 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3140  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.27 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  25.52 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  25.61 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.7 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.65 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  29.58 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.26 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.96 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.12 
 
 		 245 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  22.51 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.43 
 
 		 275 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  35.14 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  31.53 
 
 		 271 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>