67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4312 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4312  sugar phosphate isomerases/epimerases  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.517232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.97 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  hitchhiker  0.00338141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.11 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4669  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.11 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104946  hitchhiker  0.000000014237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3140  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.2 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.13 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0458  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.7 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.2 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 644 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  29.41 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  28.57 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.97 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2266  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.83 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00648615  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.7 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  26.92 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  28.06 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.57 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  34.62 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  31.01 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  25.66 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.47 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  23.46 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  27.21 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  21.59 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  23.08 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  30.26 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  28.06 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  27.56 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  27.2 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  25 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  26.62 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  26.62 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  30.7 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  25.9 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0133  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.16 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  26.98 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.29 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  24.14 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.69 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.843177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  26.09 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5480  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.2 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  0.229793 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.74 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  23.12 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  27.13 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.87 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.44 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0286  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.45 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  28.29 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  26.62 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  26.62 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  29.17 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  31.45 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.67 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  23.12 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.91 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.94 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.79 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.63 
 
 		 340 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.86 
 
 		 480 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.02 
 
 		 324 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  30.13 
 
 		 318 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.81 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>