56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0133 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0133  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0456  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.49 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  44.09 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1697  xylose isomerase domain-containing protein  42.64 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1040  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  39.2 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0916  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.84 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.55 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.54 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 843 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.21 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.13 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  29.3 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.69 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.78 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.08 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27 
 
 		 828 aa  68.9  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  28.27 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  28.83 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  28.63 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.93 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.68 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  29.34 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  24.8 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  36 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.46 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  30.61 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4312  sugar phosphate isomerases/epimerases  26.09 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.517232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2021  petrobactin biosynthesis protein AsbF  22.39 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84806e-44 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  26.96 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  22.39 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.47 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  22.39 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  22.39 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2266  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.46 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00648615  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  28.4 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  22.39 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1717  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.83 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.84 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.49 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.79 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  29.59 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3689  xylose isomerase domain-containing protein  31.03 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.2 
 
 		 536 aa  42.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.13 
 
 		 322 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  26.6 
 
 		 333 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.82 
 
 		 615 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  28.67 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 		 378 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  26.06 
 
 		 284 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  27.43 
 
 		 285 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  27.85 
 
 		 276 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.91 
 
 		 270 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.85 
 
 		 276 aa  42  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  27.85 
 
 		 276 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>