35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1697 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1697  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  38.95 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0133  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.07 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.43 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0456  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.58 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0916  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.82 
 
 		 264 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1040  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  33.58 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 843 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.26 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.45 
 
 		 265 aa  95.5  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.34 
 
 		 277 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.64 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  26.26 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.76 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.05 
 
 		 828 aa  62.4  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.45 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5338  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.01 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218973  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.17 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.95 
 
 		 333 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  27.36 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.83 
 
 		 376 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  25.7 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.46 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 699 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 699 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.64 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  24 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.85 
 
 		 333 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  24.27 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  24 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.23 
 
 		 376 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.39 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  25.65 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>