139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1355 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 335 aa  685    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  85.89 
 
 		 333 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  86.79 
 
 		 333 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  79.88 
 
 		 334 aa  551  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  83.86 
 
 		 335 aa  544  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  78.61 
 
 		 334 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  80.78 
 
 		 335 aa  544  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  78.08 
 
 		 333 aa  534  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  78.08 
 
 		 333 aa  534  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  76.58 
 
 		 333 aa  524  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  74.55 
 
 		 333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  75.45 
 
 		 335 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  78.8 
 
 		 335 aa  514  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  74.92 
 
 		 334 aa  494  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  73 
 
 		 337 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  77.04 
 
 		 334 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  74.2 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  61.14 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  60.73 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.14 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  61.7 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.25 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.13 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  56.07 
 
 		 338 aa  335  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  53.13 
 
 		 333 aa  325  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  48.85 
 
 		 347 aa  314  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1861  xylose isomerase domain-containing protein  32.22 
 
 		 351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0449  xylose isomerase-like TIM barrel  31.23 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0965  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.61 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1195  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.42 
 
 		 356 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.176107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3672  hypothetical protein  30.3 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257365  normal  0.156343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1061  xylose isomerase domain-containing protein  31.02 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.6 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0363  xylose isomerase domain-containing protein  28.05 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  31.4 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1707  hypothetical protein  29.84 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0453  xylose isomerase-like TIM barrel  31.52 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000058237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2241  xylose isomerase domain-containing protein  29.64 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00431  Xylose isomerase-like TIM barrel  29.09 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.917632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1635  xylose isomerase domain-containing protein  30.96 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2766  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.27 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.78 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.94 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0427  xylose isomerase domain-containing protein  31.74 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1275  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.47 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3092  xylose isomerase-like TIM barrel  29.48 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4568  xylose isomerase domain-containing protein  31.48 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3926  xylose isomerase domain-containing protein  28.88 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290509  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  31.53 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3647  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.08 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2826  xylose isomerase domain-containing protein  29.82 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0545  hypothetical protein  30.09 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2689  xylose isomerase-like TIM barrel  29.3 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5209  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.66 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3409  xylose isomerase domain-containing protein  29.48 
 
 		 350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.822122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.28 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0547  hypothetical protein  29.79 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3831  hypothetical protein  28.48 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0160671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  27.96 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4609  xylose isomerase domain-containing protein  29.76 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0474989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4767  xylose isomerase domain-containing protein  29.08 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.222121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0888  xylose isomerase domain-containing protein  27.71 
 
 		 351 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.372272 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2905  xylose isomerase domain-containing protein  28.96 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.33 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.27 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.27 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2788  xylose isomerase domain-containing protein  28.27 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0951209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1244  putative IolE, sugar phosphate isomerase/epimerase  28.66 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.516732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2681  xylose isomerase domain-containing protein  28.87 
 
 		 352 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.586843  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3129  endonuclease IV  25.55 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.76 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.53 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  28.08 
 
 		 304 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0049  xylose isomerase domain-containing protein  26.73 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.72 
 
 		 306 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.83 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  27.41 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  28.71 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3195  xylose isomerase domain-containing protein  26.89 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  29.02 
 
 		 305 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.98 
 
 		 323 aa  89.7  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.21 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2917  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.06 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.32 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  26.05 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  28.12 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  26.59 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2764  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.16 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2948  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.89 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4616  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.74 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.89 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5338  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.62 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218973  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0119  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.77 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33700  hypothetical protein  23.42 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.47 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.24 
 
 		 659 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>