23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5126 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  84.04 
 
 		 376 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 376 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  78.19 
 
 		 376 aa  624  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.07 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  31.34 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.17 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  36.17 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  35.11 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  35.11 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  35.11 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  35.11 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44383 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  35.11 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  35.11 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.87 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2650  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 266 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  24.21 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1134  xylose isomerase domain-containing protein  24.25 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.155957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  24.29 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  31.09 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2110  hypothetical protein  28.7 
 
 		 148 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1962  hypothetical protein  28.7 
 
 		 148 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.370718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 		 644 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>