24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3581 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  668    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  67.5 
 
 		 326 aa  447  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.56 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  66.56 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  66.56 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  66.56 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  66.56 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  66.88 
 
 		 326 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  66.32 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  24.31 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.65 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2650  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.61 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  23.04 
 
 		 376 aa  52.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.42 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.35 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.21 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.99 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2110  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1962  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.370718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.56 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  25.42 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.69 
 
 		 615 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0988  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.53 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0393582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>