23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2650 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2650  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.97 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.3 
 
 		 338 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  24.51 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.46 
 
 		 297 aa  62  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 376 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  22.61 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 376 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  27.88 
 
 		 376 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.62 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.48 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0542  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.32 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  25.71 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  24.76 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44383 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  24.76 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  24.76 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  24.76 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  24.76 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  26.52 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0413  xylose isomerase domain-containing protein  23.88 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0344  AP endonuclease  23.88 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  24.76 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.76 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>