23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5378 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 376 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  84.04 
 
 		 376 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  77.13 
 
 		 376 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.23 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.89 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  37.89 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.67 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  36.84 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  36.84 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  36.84 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  36.84 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  36.84 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  35.79 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44383 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  29.85 
 
 		 328 aa  67  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2650  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.08 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  29.35 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1134  xylose isomerase domain-containing protein  23.88 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.155957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  30.19 
 
 		 280 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 		 644 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  24.68 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  24.71 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  24.12 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>