27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4460 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 331 aa  651    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7610  hypothetical protein  30.92 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 		 376 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.74 
 
 		 338 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.23 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.43 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  23.58 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  26.17 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2650  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.62 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  28.57 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.15 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.51 
 
 		 536 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  25.45 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  25.45 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  25.45 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  25.45 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  25.45 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  27.55 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.73 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.01 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 515 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.61 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.56 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.45 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  26.57 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>