60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31660 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.21 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  24.54 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.86 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.6 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.73 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.01 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.6 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.4 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.44 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  22.92 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.24 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2650  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.46 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  23.05 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.98 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.66 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.88 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.32 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0287  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  22.11 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0115  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.41 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.221119 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  23.59 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  23.05 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.44 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  24.69 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3194  hypothetical protein  22.94 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  22.71 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  24.58 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  30.17 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0121  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  21.67 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  20.99 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  21.79 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.26 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.26 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.3 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.53 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  27.88 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  24.88 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  19.82 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.42 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  24.39 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1044  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.11 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  25.83 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  18.72 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  24.39 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.75 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.28 
 
 		 659 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.93 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  24.39 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.95 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  24.39 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.56 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0988  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  21.6 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0393582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.89 
 
 		 536 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.1 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0346457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>