33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0622 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 308 aa  610  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0182  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.59 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000874694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0883  xylose isomerase domain-containing protein  37.88 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.29 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  0.2091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1920  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.97 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3101  xylose isomerase domain-containing protein  37.23 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.67 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4227  xylose isomerase domain-containing protein  37.5 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.220336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  33.33 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.16 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.7 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  24.46 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.33 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.71 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.26 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4521  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  28.38 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.91 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.75 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2764  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.58 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  30.52 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0119  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.95 
 
 		 338 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  22.66 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5712  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.83 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.11 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.85 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.79 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.57 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.62 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  27.31 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.94 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.52 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>