16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4227 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4227  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.220336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3101  xylose isomerase domain-containing protein  77.7 
 
 		 324 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1920  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.31 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0883  xylose isomerase domain-containing protein  53.87 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0182  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.36 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000874694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  47.49 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.84 
 
 		 322 aa  286  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  0.2091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  46.15 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.5 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.77 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.62 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  28.14 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  30 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.3 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.1 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.26 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>