17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1546 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 322 aa  647    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  0.2091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0883  xylose isomerase domain-containing protein  53.82 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0182  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.19 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000874694 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3101  xylose isomerase domain-containing protein  47.51 
 
 		 324 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4227  xylose isomerase domain-containing protein  46.84 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.220336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1920  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.34 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  44.48 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  44.81 
 
 		 309 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.29 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.06 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.47 
 
 		 281 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  30.06 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  24.82 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  28.07 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.78 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5480  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.18 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  0.229793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4521  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  28.3 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.467171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>