18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0883 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0883  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  690    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0182  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.33 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000874694 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3101  xylose isomerase domain-containing protein  55.23 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4227  xylose isomerase domain-containing protein  53.87 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.220336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1920  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.15 
 
 		 338 aa  328  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.82 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  0.2091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  49.83 
 
 		 307 aa  325  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  45.18 
 
 		 309 aa  272  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.88 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.83 
 
 		 285 aa  53.1  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.26 
 
 		 289 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.86 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  32.41 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.6 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1458  xylose isomerase-like TIM barrel  28.37 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.12 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  22.18 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  23.73 
 
 		 281 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>