63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1049 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 304 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2772  xylose isomerase domain-containing protein  88.74 
 
 		 304 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  62.88 
 
 		 300 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2321  xylose isomerase domain-containing protein  62.05 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  59.87 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  59 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  58.67 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  58.67 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  58.67 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  58 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  58 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  59.33 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.86 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  57.67 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  55.18 
 
 		 287 aa  344  8e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  49.83 
 
 		 286 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  48.99 
 
 		 285 aa  314  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  49.83 
 
 		 286 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2748  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.5 
 
 		 318 aa  311  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.652978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.3 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.05 
 
 		 291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.78 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  41.58 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  40.33 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  38.03 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  36.39 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.73 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.37 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  23.92 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  21.04 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.45 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  25.43 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.69 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.84 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  24.66 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.38 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  23.53 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.94 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3407  hydroxypyruvate isomerase  32.32 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  decreased coverage  0.0000181243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.91 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.01 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.91 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  23.49 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0883  xylose isomerase domain-containing protein  20.6 
 
 		 334 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106547  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  21.53 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.44 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.28 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.18 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.66 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.76 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  27.96 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  19.79 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  23.14 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  23.51 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.41 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  27.56 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.17 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.49 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  25.64 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  23.49 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  23.95 
 
 		 259 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  21.72 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>