54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0945 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 303 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  99.01 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  98.35 
 
 		 303 aa  613  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  95.7 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  96.03 
 
 		 304 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  94.39 
 
 		 303 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  87.46 
 
 		 303 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  84.77 
 
 		 307 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.41 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.67 
 
 		 304 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2772  xylose isomerase domain-containing protein  58.33 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2321  xylose isomerase domain-containing protein  58.47 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  58.14 
 
 		 300 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  54.55 
 
 		 287 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2748  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.16 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.652978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  48.98 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  49.32 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  46.44 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.49 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  44.37 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.57 
 
 		 291 aa  242  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.87 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  38.8 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  38.16 
 
 		 294 aa  208  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  34.87 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.12 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.11 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.84 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0982928  normal  0.0112247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  22.07 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  25.58 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  20.67 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.37 
 
 		 480 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.29 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.13 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  22.05 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.03 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  24.67 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  25.44 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  23.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  23.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  23.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  23.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  23.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  23.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  23.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  29.59 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  26.67 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  23.08 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2948  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  19.8 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.08 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  22.54 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  23.59 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0122  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.65 
 
 		 627 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>