49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2927 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  630  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  85.76 
 
 		 303 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  84.44 
 
 		 303 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  84.77 
 
 		 303 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  84.77 
 
 		 303 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  84.77 
 
 		 303 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  83.77 
 
 		 304 aa  530  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  83.77 
 
 		 304 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  82.45 
 
 		 303 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.53 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2772  xylose isomerase domain-containing protein  59.33 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  57.33 
 
 		 300 aa  358  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2321  xylose isomerase domain-containing protein  58.59 
 
 		 320 aa  358  9e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  56.23 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  50.5 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  50.17 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  46.78 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2748  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.23 
 
 		 318 aa  275  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.652978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.16 
 
 		 284 aa  269  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  42.38 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.58 
 
 		 291 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.87 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  39.13 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  38.24 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  34.64 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.82 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.47 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.32 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0982928  normal  0.0112247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  25.68 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  23.78 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  26.92 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  30.16 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.52 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.72 
 
 		 480 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.43 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  24.84 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  27.03 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  27.03 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  27.03 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  24.02 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  25.6 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  26.42 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  21.05 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  19.78 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  24.36 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  26.36 
 
 		 269 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.74 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  24.58 
 
 		 260 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>