56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2772 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2772  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  88.74 
 
 		 304 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2321  xylose isomerase domain-containing protein  65.22 
 
 		 320 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  63.21 
 
 		 300 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  60.6 
 
 		 303 aa  384  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  59.33 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  58.67 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  58.33 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  58.33 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  59 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  59 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  57.67 
 
 		 304 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  57.33 
 
 		 304 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.82 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  55.85 
 
 		 287 aa  346  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  51.86 
 
 		 286 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  51.53 
 
 		 286 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2748  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.49 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.652978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  49.66 
 
 		 285 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.3 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.23 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.61 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  41.91 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  41.53 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  38.36 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  37.7 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.7 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  21.74 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  24.39 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.91 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.52 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.3 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.1 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1251  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.43 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.38 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.18 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  24.28 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.08 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  26.19 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.55 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3407  hydroxypyruvate isomerase  30.3 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  decreased coverage  0.0000181243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.05 
 
 		 289 aa  45.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  18.89 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.02 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.1 
 
 		 480 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.85 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  21.48 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  22.28 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  18.71 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  22.82 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.56 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.71 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  23.18 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1918  Hydroxypyruvate isomerase  22.65 
 
 		 260 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>