36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4718 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  100 
 
 		 294 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  78.23 
 
 		 294 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  48.46 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  46.26 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  45.58 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  40.54 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2772  xylose isomerase domain-containing protein  37.7 
 
 		 304 aa  225  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2748  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.06 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.652978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.39 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  41.43 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.37 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.65 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  41.16 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  38.36 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.49 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2321  xylose isomerase domain-containing protein  34.87 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  35.2 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  34.87 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  35.2 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  34.87 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  34.87 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  34.64 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.91 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.24 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.76 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.99 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.45 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  26.85 
 
 		 515 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.45 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.35 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0229  xylose isomerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  28.33 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>