55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0388 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  83.1 
 
 		 291 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  75.69 
 
 		 291 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  75.17 
 
 		 290 aa  471  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  56.06 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2748  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.9 
 
 		 318 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.652978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.25 
 
 		 284 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2321  xylose isomerase domain-containing protein  47.52 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  45.14 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  44.88 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  44.04 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2772  xylose isomerase domain-containing protein  41.91 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  46.15 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  44.37 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  44.37 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  44.7 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.58 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  45.45 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  44.37 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  44.37 
 
 		 303 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  44.04 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  43.67 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  42.38 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.86 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  41.16 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  41.16 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.78 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  25.22 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  23.16 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.89 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  22.86 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.49 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  25 
 
 		 480 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  24.28 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.26 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.22 
 
 		 307 aa  45.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  21.89 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  24.47 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  25.32 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0649  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  25.49 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2729  xylose isomerase domain-containing protein  23.22 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1081  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.08 
 
 		 628 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796659  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0229  xylose isomerase domain-containing protein  34.48 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.5 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  21.39 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  21.8 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.26 
 
 		 322 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.29 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  22.04 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  25.15 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  27.97 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.46 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.51 
 
 		 339 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.53 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>