62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0943 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0826  xylose isomerase domain-containing protein  91.26 
 
 		 290 aa  557  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  80.21 
 
 		 291 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0388  xylose isomerase domain-containing protein  75.69 
 
 		 290 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  54.17 
 
 		 287 aa  322  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2748  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.08 
 
 		 318 aa  308  8e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.652978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2321  xylose isomerase domain-containing protein  45.7 
 
 		 320 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2772  xylose isomerase domain-containing protein  43.23 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.549003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.53 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50120  myo-inositol catabolism protein IolH  44.83 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  44.85 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3267  AP endonuclease  45.96 
 
 		 286 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3493  iolH protein  44.95 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00667421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.05 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  39.53 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  39.87 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  40 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  39.87 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  39.87 
 
 		 303 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  39.87 
 
 		 303 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  39.87 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  39.87 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  39.87 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4657  xylose isomerase domain-containing protein  40.43 
 
 		 294 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4718  protein IolH  41.37 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.745442  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.59 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.78 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.51 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.33 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  22.85 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  24.77 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  26.46 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.81 
 
 		 480 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.1 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  23.57 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.35 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.38 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  23.88 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  23.11 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  24.81 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.4 
 
 		 338 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.56 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  22.67 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.77 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  24.1 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.5 
 
 		 334 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.34 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  24 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  22.18 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  24.6 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.63 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.97 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  23.08 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  25.9 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.22 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  21.53 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.78 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0229  xylose isomerase domain-containing protein  31.75 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.66 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  24.86 
 
 		 515 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>