144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0649 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  616  1e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  24.9 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  25.1 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  23.23 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.45 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.66 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.8 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  30 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.8 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.15 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0504  xylose isomerase domain-containing protein  29.25 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  27.87 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.75 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  32.69 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.79 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.67 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  24.46 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  28.89 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  29.27 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.26 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  30.85 
 
 		 264 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.73 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  21.77 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  22.12 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  22.36 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  30.51 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.33 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  21.77 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  21.77 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  22.22 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  24.12 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5223  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.93 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal  0.643563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.66 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  22.87 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2929  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.01 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.712071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.63 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  25.74 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  21.75 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  22.79 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.72 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00458  hydroxypyruvate isomerase  22.76 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3104  hydroxypyruvate isomerase  22.76 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00463  hypothetical protein  22.76 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  32.05 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0582  hydroxypyruvate isomerase  22.76 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0545  hydroxypyruvate isomerase  22.76 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3114  hydroxypyruvate isomerase  22.76 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0609  hydroxypyruvate isomerase  22.76 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  21.81 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  24.26 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.06 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  24.14 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  24.14 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.14 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  24.14 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  21.38 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  23.58 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  24.14 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  22.05 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2311  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  27.97 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0943  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.1 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  28 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  29.87 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  24.63 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  25.41 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  28.29 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.56 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  19.59 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  23.53 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0551  hydroxypyruvate isomerase  21.38 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1808  AP endonuclease  24.14 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.43 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  22.05 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.05 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  22.05 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  26.71 
 
 		 281 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  23.91 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4619  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.79 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154569  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.25 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  24.42 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  25.18 
 
 		 298 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.59 
 
 		 264 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.25 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  22.9 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.78 
 
 		 480 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  23.28 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4459  xylose isomerase-like TIM barrel  25.93 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.04 
 
 		 905 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 		 843 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3635  xylose isomerase domain-containing protein  23.97 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  24.09 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  21.28 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  25.83 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  22.05 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  22.84 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  22.05 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>