111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2524 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  593  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  30.51 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  31.1 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  32.97 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.1 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.37 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.94 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0982928  normal  0.0112247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.9 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.43 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.33 
 
 		 480 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2286  xylose isomerase domain-containing protein  26.48 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0370511  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3593  xylose isomerase domain-containing protein  26.36 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  decreased coverage  0.000150106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.55 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.41 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  24.81 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2684  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  32.32 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 		 699 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 		 699 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  25.47 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  22.18 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.18 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  22.18 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  25.87 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  28.07 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.05 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0409  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.54 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  21.67 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  24.03 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  24.78 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  25.97 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  24.7 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.18 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.71 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  29.85 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  25.27 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  31.51 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.79 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.71 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  34.12 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.53 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  25.99 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  27.84 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  26.27 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  22.9 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  26.54 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.12 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.29 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  29.46 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  20.92 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  28.81 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  21.67 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  26.4 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  21.86 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  28.4 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  22.73 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  27.17 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  25.48 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.08 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.42 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.61 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  27.12 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  22.64 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  21.17 
 
 		 333 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  28.28 
 
 		 243 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  33.1 
 
 		 265 aa  45.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  25.35 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1649  AP endonuclease  20.88 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00681404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  22.53 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  26.06 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.97 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  23.12 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  27.47 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.69 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  23.32 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  28.69 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  24.17 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.44 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  23.94 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  31.17 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  24.29 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19810  hydroxypyruvate isomerase protein  24.23 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.68 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  23.94 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  27.98 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5867  xylose isomerase domain-containing protein  25.36 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  23.89 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.78 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  27.84 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  23.33 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>