19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1649 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1649  AP endonuclease  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00681404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1387  endonuclease  96.1 
 
 		 154 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000563748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1388  endonuclease  93.94 
 
 		 85 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  20.63 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.82 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  21.86 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  19.78 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  22.78 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  24.91 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  19.55 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  20 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  20.38 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.89 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1320  hexulose-6-phosphate isomerase  22.65 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.05 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  22.18 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.99 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.61 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>