42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1640 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 270 aa  543  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264646  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.31 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.35 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.5 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.18 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.62 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  22.75 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  22.79 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.86 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  24.77 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  21.54 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  20.27 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  20 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1649  AP endonuclease  28.1 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00681404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  24.12 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1387  endonuclease  28.19 
 
 		 154 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000563748  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.04 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33680  hypothetical protein  23.26 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.44 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0287  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  29.27 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  23.58 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  21.94 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  24.88 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0458  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.44 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  19.7 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.76 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  19.39 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  23.49 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  19.92 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.18 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  19.92 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  19.92 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  23.45 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.12 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.09 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  21.3 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  29.57 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  20.41 
 
 		 305 aa  42  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2266  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.31 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00648615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.17 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0121  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  26.74 
 
 		 290 aa  42  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  19.62 
 
 		 281 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>