150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3432 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 316 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0982928  normal  0.0112247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  30.94 
 
 		 287 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.73 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3593  xylose isomerase domain-containing protein  35.88 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  decreased coverage  0.000150106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.97 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2684  xylose isomerase domain-containing protein  33.97 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.23 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2286  xylose isomerase domain-containing protein  36.26 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0370511  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.68 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  30.69 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.31 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  26.79 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.21 
 
 		 284 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.29 
 
 		 480 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.73 
 
 		 313 aa  95.9  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  26.64 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0945  xylose isomerase-like TIM barrel  25.53 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1427  xylose isomerase domain-containing protein  25.53 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1405  xylose isomerase domain-containing protein  25.08 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4571  xylose isomerase-like TIM barrel  25.08 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.985344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1346  xylose isomerase domain-containing protein  25.08 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1307  xylose isomerase domain-containing protein  25.9 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1888  xylose isomerase domain-containing protein  25.49 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  33.57 
 
 		 259 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1244  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  24.43 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.341536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  27.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.31 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  26.4 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2927  xylose isomerase domain-containing protein  25.32 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837933  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  25.51 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  25.51 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  25.51 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  26.95 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  33.8 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  27.68 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  27.66 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  28.95 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  34.04 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  28.95 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.55 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  29.79 
 
 		 264 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  33.81 
 
 		 267 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1810  xylose isomerase domain-containing protein  23.73 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.753291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  28.07 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  34.13 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  25.93 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  29.55 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3899  hydroxypyruvate isomerase  25.68 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3564  xylose isomerase domain-containing protein  28.51 
 
 		 257 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.16 
 
 		 284 aa  52.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.19 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.74 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  31.86 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.85 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  27.66 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4186  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.11 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  31.25 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  27.66 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  28.03 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  28.65 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  28.65 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  28.79 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.99 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  28.72 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  30.88 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  28.79 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2748  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.18 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.652978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  36.14 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  30.53 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  25 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3282  hydroxypyruvate isomerase protein  29.01 
 
 		 260 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.257483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  29.36 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  28.79 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.4 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2758  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.73 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  28.79 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4098  hydroxypyruvate isomerase  31.25 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  27.66 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  32.52 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2745  AP endonuclease  22.22 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  29.46 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1461  AP endonuclease  22.22 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331039  normal  0.325369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2823  hydroxypyruvate isomerase  22.22 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.64 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4562  hydroxypyruvate isomerase  28.72 
 
 		 259 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.3 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  31.91 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  30.09 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  26.47 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  25.29 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2625  hydroxypyruvate isomerase  31.91 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  27.66 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  27.66 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  25.15 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  26.72 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1902  xylose isomerase domain-containing protein  32.6 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  26.95 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  26.95 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>