128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4651 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  100 
 
 
334 aa  685    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  80.97 
 
 
334 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  78.61 
 
 
335 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  76.28 
 
 
335 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  79.3 
 
 
335 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  78.33 
 
 
335 aa  527  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  74.62 
 
 
333 aa  528  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  76.51 
 
 
335 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  74.47 
 
 
333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  76.97 
 
 
334 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  71.52 
 
 
333 aa  484  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  71.6 
 
 
333 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  71.6 
 
 
333 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  71.3 
 
 
333 aa  477  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  69.76 
 
 
337 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  72.47 
 
 
338 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  70.89 
 
 
334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  62.84 
 
 
332 aa  427  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  63.14 
 
 
332 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  62.05 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.39 
 
 
331 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.05 
 
 
332 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.63 
 
 
339 aa  388  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  55.94 
 
 
338 aa  352  7e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  53.64 
 
 
333 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  51.31 
 
 
347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1861  xylose isomerase domain-containing protein  34.04 
 
 
351 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0410034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  35.26 
 
 
359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0453  xylose isomerase-like TIM barrel  33.73 
 
 
351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000058237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1707  hypothetical protein  33.22 
 
 
351 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0449  xylose isomerase-like TIM barrel  32.84 
 
 
352 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0965  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.74 
 
 
349 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2766  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.55 
 
 
351 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00431  Xylose isomerase-like TIM barrel  32.35 
 
 
355 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.917632  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3672  hypothetical protein  31.74 
 
 
349 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257365  normal  0.156343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2689  xylose isomerase-like TIM barrel  33.44 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  34.53 
 
 
352 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.13 
 
 
350 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0363  xylose isomerase domain-containing protein  29.18 
 
 
350 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2826  xylose isomerase domain-containing protein  31.07 
 
 
378 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.76 
 
 
350 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3092  xylose isomerase-like TIM barrel  31.78 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3926  xylose isomerase domain-containing protein  32.14 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290509  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1635  xylose isomerase domain-containing protein  30.95 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3647  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.25 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0888  xylose isomerase domain-containing protein  30.15 
 
 
351 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.372272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  30.75 
 
 
351 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5209  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.82 
 
 
351 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1195  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.49 
 
 
356 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.176107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0427  xylose isomerase domain-containing protein  32.14 
 
 
341 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4609  xylose isomerase domain-containing protein  31.45 
 
 
351 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0474989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.45 
 
 
350 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296998  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4568  xylose isomerase domain-containing protein  31.82 
 
 
354 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.82 
 
 
351 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1061  xylose isomerase domain-containing protein  30.91 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2241  xylose isomerase domain-containing protein  29.64 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1275  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 
356 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.45 
 
 
356 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0545  hypothetical protein  29.55 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3129  endonuclease IV  27.16 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.66 
 
 
350 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.66 
 
 
350 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3831  hypothetical protein  28.66 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0160671  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3409  xylose isomerase domain-containing protein  28.96 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.822122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0547  hypothetical protein  29.25 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2788  xylose isomerase domain-containing protein  28.66 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0951209  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4767  xylose isomerase domain-containing protein  28.66 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.222121  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2681  xylose isomerase domain-containing protein  27.76 
 
 
352 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.586843  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2905  xylose isomerase domain-containing protein  27.16 
 
 
352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1244  putative IolE, sugar phosphate isomerase/epimerase  27.16 
 
 
352 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.516732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  29.34 
 
 
304 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  29.09 
 
 
305 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  29.09 
 
 
305 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  30.84 
 
 
305 aa  99  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.05 
 
 
304 aa  99  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  25.96 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.94 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.09 
 
 
322 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0049  xylose isomerase domain-containing protein  26.14 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.5 
 
 
277 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2917  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.35 
 
 
304 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409323  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 
306 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.03 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3195  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.39 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  26.04 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  26.04 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  26.09 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2948  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.89 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33700  hypothetical protein  26.14 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  27.78 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.92 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2764  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4616  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.2 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.04 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.84 
 
 
659 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197966  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0119  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.12 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5338  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.91 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218973  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.92 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>