112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1620 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 323 aa  651    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  73.37 
 
 		 322 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  73.37 
 
 		 322 aa  481  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  72.59 
 
 		 321 aa  482  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.2 
 
 		 322 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2948  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.06 
 
 		 323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  43.48 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  43.48 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0049  xylose isomerase domain-containing protein  41.46 
 
 		 315 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3195  xylose isomerase domain-containing protein  37.54 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  35.06 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4616  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.47 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33700  hypothetical protein  35.44 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0119  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.03 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2764  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.53 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  30.75 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  30.33 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.49 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  28.96 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.68 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  30.48 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  28.62 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.7 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.49 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.94 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  28.4 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  29.34 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  28.43 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.53 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  25.82 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.35 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.98 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.71 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.62 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.45 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.43 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  28.44 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  27.13 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.84 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.92 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  26.18 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.08 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.74 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5338  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.53 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218973  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  27.48 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  27.16 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2689  xylose isomerase-like TIM barrel  28.1 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.67 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.56 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2917  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0363  xylose isomerase domain-containing protein  26.1 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  26.48 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.47 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  28.09 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00431  Xylose isomerase-like TIM barrel  26.89 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.917632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0965  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.89 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0545  hypothetical protein  27.11 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0547  hypothetical protein  27.11 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.16 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1195  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.74 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.176107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3672  hypothetical protein  25.53 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257365  normal  0.156343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4568  xylose isomerase domain-containing protein  28.67 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4609  xylose isomerase domain-containing protein  27.24 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0474989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.39 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.39 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3409  xylose isomerase domain-containing protein  29.2 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.822122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0427  xylose isomerase domain-containing protein  27.81 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1707  hypothetical protein  26.2 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1861  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4691  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.48 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3647  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.92 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.67 
 
 		 659 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2766  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.84 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.76 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3926  xylose isomerase domain-containing protein  24.36 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290509  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.39 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3092  xylose isomerase-like TIM barrel  25.62 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3129  endonuclease IV  28.7 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1635  xylose isomerase domain-containing protein  25.71 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2788  xylose isomerase domain-containing protein  29.03 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0951209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3831  hypothetical protein  27.92 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0160671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0453  xylose isomerase-like TIM barrel  27.76 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000058237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2905  xylose isomerase domain-containing protein  24.58 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1061  xylose isomerase domain-containing protein  26.91 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.31 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1244  putative IolE, sugar phosphate isomerase/epimerase  24.17 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.516732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1275  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.31 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2681  xylose isomerase domain-containing protein  24.17 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.586843  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  26.48 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4767  xylose isomerase domain-containing protein  25.91 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.222121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2241  xylose isomerase domain-containing protein  26.52 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0888  xylose isomerase domain-containing protein  25.08 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.372272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0449  xylose isomerase-like TIM barrel  27.91 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2826  xylose isomerase domain-containing protein  24.1 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>