144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0888 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0888  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  723    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.372272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5209  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  74.57 
 
 		 351 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  73.71 
 
 		 350 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3409  xylose isomerase domain-containing protein  73.43 
 
 		 350 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.822122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  72.29 
 
 		 350 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  72.29 
 
 		 350 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1861  xylose isomerase domain-containing protein  70.09 
 
 		 351 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410034 
 
 
-
 
NC_004310  BR0545  hypothetical protein  72 
 
 		 350 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0453  xylose isomerase-like TIM barrel  72.57 
 
 		 351 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000058237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3672  hypothetical protein  72.86 
 
 		 349 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257365  normal  0.156343 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0547  hypothetical protein  71.71 
 
 		 350 aa  527  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3831  hypothetical protein  72.57 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0160671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2788  xylose isomerase domain-containing protein  70.86 
 
 		 350 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0951209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  71.35 
 
 		 352 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0965  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  72.57 
 
 		 349 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4609  xylose isomerase domain-containing protein  72.36 
 
 		 351 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0474989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1707  hypothetical protein  70.32 
 
 		 351 aa  519  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0363  xylose isomerase domain-containing protein  70.86 
 
 		 350 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  69.52 
 
 		 351 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2689  xylose isomerase-like TIM barrel  70.86 
 
 		 350 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0427  xylose isomerase domain-containing protein  74.33 
 
 		 341 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2241  xylose isomerase domain-containing protein  72 
 
 		 349 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3129  endonuclease IV  71.94 
 
 		 336 aa  512  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1244  putative IolE, sugar phosphate isomerase/epimerase  69.8 
 
 		 352 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.516732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2905  xylose isomerase domain-containing protein  69.8 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  69.54 
 
 		 359 aa  505  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2681  xylose isomerase domain-containing protein  69.23 
 
 		 352 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.586843  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4568  xylose isomerase domain-containing protein  67.43 
 
 		 354 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00431  Xylose isomerase-like TIM barrel  69.14 
 
 		 355 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.917632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3647  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.43 
 
 		 350 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.29 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2826  xylose isomerase domain-containing protein  66.1 
 
 		 378 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66 
 
 		 350 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1195  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.39 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.176107  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4767  xylose isomerase domain-containing protein  65.43 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.222121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1061  xylose isomerase domain-containing protein  67.16 
 
 		 341 aa  480  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0449  xylose isomerase-like TIM barrel  65.04 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1275  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.53 
 
 		 356 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  63.25 
 
 		 351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.53 
 
 		 356 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1635  xylose isomerase domain-containing protein  63.92 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3926  xylose isomerase domain-containing protein  61.71 
 
 		 351 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290509  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2766  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.14 
 
 		 351 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3092  xylose isomerase-like TIM barrel  61.43 
 
 		 351 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.98 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.31 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.51 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.99 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.67 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  33.1 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.53 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  33 
 
 		 333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  31.45 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.15 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  30.92 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  31.46 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.45 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  33.23 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.62 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.56 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.74 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  33.45 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.71 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  29.71 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  29.39 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  30.92 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.22 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.15 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.71 
 
 		 335 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  23.6 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.4 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  26.06 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.08 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.22 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.96 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  26.17 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  21.54 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  26.63 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  26.7 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  30.81 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  26.99 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  27.57 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  27.08 
 
 		 297 aa  52.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  28.86 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.12 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  27.71 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 924 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.78 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.95 
 
 		 659 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197966  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  27.91 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  25.65 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.72 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  28 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.67 
 
 		 305 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  25.17 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>