107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3129 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3129  endonuclease IV  100 
 
 		 336 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  78.57 
 
 		 351 aa  564  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1707  hypothetical protein  73.49 
 
 		 351 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0363  xylose isomerase domain-containing protein  71.64 
 
 		 350 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2689  xylose isomerase-like TIM barrel  71.13 
 
 		 350 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5209  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  71.94 
 
 		 351 aa  514  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0453  xylose isomerase-like TIM barrel  71.34 
 
 		 351 aa  511  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000058237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0888  xylose isomerase domain-containing protein  71.94 
 
 		 351 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.372272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3647  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  70.75 
 
 		 350 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3672  hypothetical protein  69.05 
 
 		 349 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257365  normal  0.156343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0427  xylose isomerase domain-containing protein  70.15 
 
 		 341 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0965  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  69.35 
 
 		 349 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2241  xylose isomerase domain-containing protein  69.64 
 
 		 349 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00431  Xylose isomerase-like TIM barrel  71.04 
 
 		 355 aa  498  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.917632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  68.36 
 
 		 350 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1861  xylose isomerase domain-containing protein  67.16 
 
 		 351 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3831  hypothetical protein  69.55 
 
 		 350 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0160671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2788  xylose isomerase domain-containing protein  68.06 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0951209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  68.56 
 
 		 352 aa  487  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.86 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.86 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0545  hypothetical protein  66.87 
 
 		 350 aa  484  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.26 
 
 		 350 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0547  hypothetical protein  66.57 
 
 		 350 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3409  xylose isomerase domain-containing protein  67.16 
 
 		 350 aa  481  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.822122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  66.07 
 
 		 351 aa  481  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  67.47 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2681  xylose isomerase domain-containing protein  66.37 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.586843  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1244  putative IolE, sugar phosphate isomerase/epimerase  65.77 
 
 		 352 aa  474  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.516732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2905  xylose isomerase domain-containing protein  65.77 
 
 		 352 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4609  xylose isomerase domain-containing protein  67.06 
 
 		 351 aa  474  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0474989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4568  xylose isomerase domain-containing protein  64.18 
 
 		 354 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.77 
 
 		 350 aa  471  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0449  xylose isomerase-like TIM barrel  64.97 
 
 		 352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1635  xylose isomerase domain-containing protein  64.09 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3926  xylose isomerase domain-containing protein  63.1 
 
 		 351 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290509  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3092  xylose isomerase-like TIM barrel  62.5 
 
 		 351 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2826  xylose isomerase domain-containing protein  63.77 
 
 		 378 aa  458  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4767  xylose isomerase domain-containing protein  61.79 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.222121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1061  xylose isomerase domain-containing protein  62.69 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2766  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.01 
 
 		 351 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1195  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.49 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.176107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.28 
 
 		 356 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1275  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62.99 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.46 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.3 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.39 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.85 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  29.94 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  29.62 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  29.39 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  31.58 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  31.11 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.46 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  29.62 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.74 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.8 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  29.37 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  30.67 
 
 		 347 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.16 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.39 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.28 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  27.45 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.98 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  27.41 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  27.1 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.55 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.53 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.18 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.56 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.03 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.7 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.94 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  23.1 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  21.3 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.42 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  26.59 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.35 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  26.35 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  24.41 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  25 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.21 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  25.35 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  20.39 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.25 
 
 		 924 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  20.78 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  25.57 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  27.07 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.4 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  25.2 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  24 
 
 		 297 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  25.25 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.56 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  26.75 
 
 		 298 aa  46.2  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  25 
 
 		 298 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  24.06 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.34 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.56 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  23.98 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>