119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2792 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  94.75 
 
 		 305 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  60 
 
 		 305 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  55.26 
 
 		 304 aa  352  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  50.82 
 
 		 304 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50 
 
 		 304 aa  311  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.03 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2917  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.54 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  48.73 
 
 		 308 aa  291  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.11 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.64 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5338  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.04 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218973  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.67 
 
 		 277 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4691  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.98 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.58 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.25 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.83 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2948  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.4 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5396  hypothetical protein  29.92 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0868602  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4917  xylose isomerase domain-containing protein  29.48 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.462134 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.13 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905747  hitchhiker  0.000288206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.75 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.38 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6571  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.86 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00340356  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.75 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  30.55 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.97 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.09 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0049  xylose isomerase domain-containing protein  30.25 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  29.43 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  29.43 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  27.69 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.21 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  28.16 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  27.79 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  27.79 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.71 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.43 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.71 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  28.48 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.62 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.81 
 
 		 331 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.02 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  32.86 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  32.86 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.98 
 
 		 338 aa  86.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  28.21 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.88 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.33 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4616  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.5 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  26.32 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.72 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2764  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.88 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0119  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.43 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  24.04 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  24.78 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.82 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  24.06 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  23.76 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.91 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0453  xylose isomerase-like TIM barrel  23.31 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000058237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2766  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.85 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00431  Xylose isomerase-like TIM barrel  22.32 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.917632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0545  hypothetical protein  24.2 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3434  xylose isomerase domain-containing protein  23.84 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0449  xylose isomerase-like TIM barrel  24.57 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.73 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3092  xylose isomerase-like TIM barrel  23.11 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3195  xylose isomerase domain-containing protein  25.25 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  24.24 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3831  hypothetical protein  23.2 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0160671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0965  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.26 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1275  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.37 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.65 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.56 
 
 		 659 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197966  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0547  hypothetical protein  23.84 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2826  xylose isomerase domain-containing protein  24.18 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3672  hypothetical protein  22.44 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257365  normal  0.156343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  24.52 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1635  xylose isomerase domain-containing protein  21.97 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1861  xylose isomerase domain-containing protein  22.65 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3926  xylose isomerase domain-containing protein  22.48 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290509  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33700  hypothetical protein  24.04 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.3 
 
 		 350 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  24.05 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.55 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5751  xylose isomerase domain-containing protein  22.15 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3409  xylose isomerase domain-containing protein  24.18 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.822122  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4767  xylose isomerase domain-containing protein  25.35 
 
 		 350 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.222121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1195  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.3 
 
 		 356 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.176107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.78 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0363  xylose isomerase domain-containing protein  20.27 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2241  xylose isomerase domain-containing protein  22.45 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3129  endonuclease IV  20.39 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.65 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2689  xylose isomerase-like TIM barrel  19.46 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.03 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0427  xylose isomerase domain-containing protein  21.51 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>