170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00431 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00431  Xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 355 aa  737    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.917632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2689  xylose isomerase-like TIM barrel  81.84 
 
 		 350 aa  593  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  71.75 
 
 		 359 aa  541  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0427  xylose isomerase domain-containing protein  76.05 
 
 		 341 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4328  xylose isomerase domain-containing protein  71.76 
 
 		 352 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  69.91 
 
 		 351 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2241  xylose isomerase domain-containing protein  70.4 
 
 		 349 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4609  xylose isomerase domain-containing protein  70 
 
 		 351 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0474989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0363  xylose isomerase domain-containing protein  68.88 
 
 		 350 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1707  hypothetical protein  68.3 
 
 		 351 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0965  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  69.54 
 
 		 349 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3672  hypothetical protein  68.97 
 
 		 349 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257365  normal  0.156343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3129  endonuclease IV  71.04 
 
 		 336 aa  498  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0453  xylose isomerase-like TIM barrel  67.91 
 
 		 351 aa  495  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000058237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0888  xylose isomerase domain-containing protein  69.14 
 
 		 351 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.372272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1861  xylose isomerase domain-containing protein  67.14 
 
 		 351 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.05 
 
 		 350 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1049  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.48 
 
 		 350 aa  484  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.9 
 
 		 350 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.9 
 
 		 350 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5209  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.15 
 
 		 351 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3831  hypothetical protein  66.19 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0160671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1635  xylose isomerase domain-containing protein  65.62 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.76 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0545  hypothetical protein  65.04 
 
 		 350 aa  474  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2788  xylose isomerase domain-containing protein  65.33 
 
 		 350 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0951209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3409  xylose isomerase domain-containing protein  65.33 
 
 		 350 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.822122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0449  xylose isomerase-like TIM barrel  65.04 
 
 		 352 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0547  hypothetical protein  64.76 
 
 		 350 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3647  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  64.18 
 
 		 350 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1195  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62 
 
 		 356 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.176107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4568  xylose isomerase domain-containing protein  61.96 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1244  putative IolE, sugar phosphate isomerase/epimerase  61.65 
 
 		 352 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.516732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2905  xylose isomerase domain-containing protein  61.36 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2681  xylose isomerase domain-containing protein  61.36 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.586843  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1061  xylose isomerase domain-containing protein  62.65 
 
 		 341 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  62 
 
 		 351 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4767  xylose isomerase domain-containing protein  61.6 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.222121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2766  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.17 
 
 		 351 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3092  xylose isomerase-like TIM barrel  59.89 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1275  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  62 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.71 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3926  xylose isomerase domain-containing protein  59.6 
 
 		 351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290509  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2826  xylose isomerase domain-containing protein  61.02 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  33.65 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.09 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  35.26 
 
 		 333 aa  175  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  33.97 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  33.97 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.05 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.13 
 
 		 334 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  33.55 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.21 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.71 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  32.72 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  33.55 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  33.22 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  32.35 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.09 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  33.54 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.28 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.33 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  30.57 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.5 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  29.81 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.47 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  29.49 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.31 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.09 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.89 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.91 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  25.08 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.93 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.92 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.23 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  22.09 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.16 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  23.31 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  30.32 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  24.88 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.75 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  25.17 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  22.32 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  26.32 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.56 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.99 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  29.06 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.07 
 
 		 924 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.63 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  27.5 
 
 		 308 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.16 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  25.52 
 
 		 297 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.46 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  26.7 
 
 		 306 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  29.45 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.64 
 
 		 312 aa  52.8  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  29.23 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>