29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3434 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3434  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  630  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5751  xylose isomerase domain-containing protein  66.67 
 
 		 304 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0344  AP endonuclease  53.97 
 
 		 299 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0413  xylose isomerase domain-containing protein  53.97 
 
 		 299 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  30.96 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.47 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.96 
 
 		 536 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5486  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.03 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.248686 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5223  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.13 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal  0.643563 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2729  xylose isomerase domain-containing protein  23.57 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0124  xylose isomerase domain-containing protein  22.71 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5712  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.68 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.04 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.69 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207332  normal  0.133468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  34.09 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  23.33 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  23.84 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  23.08 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.55 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.65 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.49 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  23.08 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  23.66 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  24.47 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  20.66 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  21.73 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.63 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.53 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>