16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4026 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 311 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207332  normal  0.133468 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5712  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.23 
 
 		 290 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0124  xylose isomerase domain-containing protein  35.25 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5751  xylose isomerase domain-containing protein  23.55 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3434  xylose isomerase domain-containing protein  22.69 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.21 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0344  AP endonuclease  22.8 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0413  xylose isomerase domain-containing protein  22.8 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.31 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0649  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  22.75 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.17 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  21.4 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.04 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1320  hexulose-6-phosphate isomerase  21.69 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.75 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>