15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0124 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0124  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.25 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207332  normal  0.133468 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5712  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.99 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3434  xylose isomerase domain-containing protein  22.71 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  23.61 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.72 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  21.98 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2729  xylose isomerase domain-containing protein  21.83 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5751  xylose isomerase domain-containing protein  20.51 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  23.42 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0344  AP endonuclease  22.58 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0413  xylose isomerase domain-containing protein  22.58 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.9 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.61 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  24.02 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>