38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1361 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.93 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2729  xylose isomerase domain-containing protein  33.21 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3434  xylose isomerase domain-containing protein  30.96 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0344  AP endonuclease  29.54 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0413  xylose isomerase domain-containing protein  29.54 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5751  xylose isomerase domain-containing protein  25.59 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5223  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.31 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal  0.643563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.34 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207332  normal  0.133468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.14 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5486  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.51 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.248686 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  27.87 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2917  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.27 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0124  xylose isomerase domain-containing protein  23.61 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.4 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  26.75 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2948  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.42 
 
 		 323 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 843 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.58 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  21.61 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  27.68 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5488  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.83 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  22.31 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  21.54 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3194  hypothetical protein  25.34 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.86 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  26.23 
 
 		 515 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  24.18 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  25.55 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1917  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.82 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.39 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.88 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1941  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.82 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  23.63 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2144  hypothetical protein  29.82 
 
 		 148 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.04 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.14 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.04 
 
 		 306 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>