27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5486 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5486  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.248686 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5223  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  86.83 
 
 		 281 aa  477  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal  0.643563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3434  xylose isomerase domain-containing protein  24.83 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5751  xylose isomerase domain-containing protein  27.8 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0344  AP endonuclease  24.31 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0413  xylose isomerase domain-containing protein  24.31 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.22 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  25.36 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2729  xylose isomerase domain-containing protein  21.9 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.89 
 
 		 536 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.36 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  28.9 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.3 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2929  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.712071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.66 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.19 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  22.32 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.37 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2335  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.74 
 
 		 271 aa  45.8  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.6 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.94 
 
 		 480 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  24.88 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  25.73 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2848  xylose isomerase-like TIM barrel  25.43 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.561386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1679  xylose isomerase domain-containing protein  25.69 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.04 
 
 		 274 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>