64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0433 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.67 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4310  sugar phosphate isomerase/epimerase  33.22 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  30.45 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2335  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.94 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.81 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0346457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0778  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.08 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0102757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.89 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.16 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.38 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.28 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  23.66 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.61 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 		 843 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.6 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1444  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.39 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.12 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1134  xylose isomerase domain-containing protein  25.67 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.155957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3717  xylose isomerase-like TIM barrel  22.71 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0568  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.99 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.3 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2544  xylose isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  24.3 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.07 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  22.82 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  22.82 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2766  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.27 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  23.27 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0331  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.36 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  22.95 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.41 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0121  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.06 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  22.41 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.29 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  22.41 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  22.41 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  22.41 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  22.41 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  29.57 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  21.88 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5223  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.42 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal  0.643563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0287  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.73 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.92 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  24.64 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  26.56 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  28.47 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.72 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.01 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3092  xylose isomerase-like TIM barrel  21.84 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.52 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1229  xylose isomerase domain-containing protein  27.56 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1320  hexulose-6-phosphate isomerase  21.49 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.1 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3708  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.19 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1195  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.45 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.176107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3626  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.46 
 
 		 338 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  23.81 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.98 
 
 		 281 aa  42.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  27.21 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  27.94 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.53 
 
 		 300 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>