108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1113 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 277 aa  578  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.98 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.73 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.83 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 843 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.7 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.56 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.15 
 
 		 828 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  29.67 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0133  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.54 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  29.56 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0456  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.31 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.19 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1697  xylose isomerase domain-containing protein  26.59 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1040  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.5 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.63 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.44 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  26.38 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.34 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.11 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.96 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0115  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.22 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.221119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.75 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.73 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.67 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  28.22 
 
 		 515 aa  58.9  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  21.11 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.77 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.78 
 
 		 322 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1134  xylose isomerase domain-containing protein  22.57 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.155957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0916  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.32 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2335  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.99 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.44 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  23.6 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.71 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  24.02 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  24.02 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  22.74 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  23.4 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  26.47 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  23.64 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  24.24 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5480  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.12 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  0.229793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.18 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  24.84 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.84 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  24.84 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  22.74 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  24.84 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.36 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.23 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  22.55 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.41 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  25.48 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1444  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.29 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  24.24 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2976  xylose isomerase domain-containing protein  24.02 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0778  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.62 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0102757 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  22.62 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.73 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  22.47 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  23.16 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  23.46 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  21.84 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  23.02 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  21.84 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.42 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179801  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  23.42 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  24.68 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2140  Hydroxypyruvate isomerase  24.46 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.08 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  25.28 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.68 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.331171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  23.81 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  23.87 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  23.35 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.79 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  22.97 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  23.73 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  25.56 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.22 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.72 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.23 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0554  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.67 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  25.11 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  26.73 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  22.3 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  22.3 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  25.24 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  22.3 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  24.82 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3527  xylose isomerase domain-containing protein  24.58 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  20.87 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.76 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  27.66 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  22.49 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  22.49 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  22.49 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  25.24 
 
 		 350 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>