29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1040 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1040  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0133  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.2 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0916  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.22 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  40.94 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1697  xylose isomerase domain-containing protein  33.71 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0456  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.46 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.5 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  25.78 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 843 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.88 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.8 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.7 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  28.99 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  23.26 
 
 		 326 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2365  hydroxypyruvate isomerase  29.81 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  22.67 
 
 		 326 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.67 
 
 		 326 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.31 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  22.09 
 
 		 326 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  22.09 
 
 		 326 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  22.09 
 
 		 326 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  21.84 
 
 		 292 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  22.09 
 
 		 326 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  31.79 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  28.48 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.69 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>