92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4058 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 278 aa  554  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  99.64 
 
 		 278 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  93.88 
 
 		 278 aa  501  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  54.2 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.25 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3527  xylose isomerase domain-containing protein  52.19 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  44.94 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  44.57 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2021  petrobactin biosynthesis protein AsbF  44.57 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84806e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  44.57 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  44.57 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  43.07 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  42.7 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  41.95 
 
 		 280 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28960  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.52 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.32 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.72 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3582  xylose isomerase domain-containing protein  30.29 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  25.33 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.25 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0778  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.7 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0102757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  25.68 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.5 
 
 		 924 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  32.61 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.02 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.63 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.61 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.68 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  26.09 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.61 
 
 		 322 aa  48.9  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  23.7 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.38 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  26.67 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1040  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  32.31 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  30.05 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  34.62 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  28.7 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  27.04 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  28.57 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.53 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.78 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0568  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.26 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  29.32 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  34.62 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  29.32 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  34.62 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2490  xylose isomerase domain-containing protein  34.09 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00709656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  34.21 
 
 		 371 aa  45.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  32.69 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  28.45 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3261  hypothetical protein  27.31 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.879119  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  32.34 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  22.5 
 
 		 635 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  30.86 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  25.88 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  28.79 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  25.71 
 
 		 629 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  26.98 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1913  Hydroxypyruvate isomerase  27.46 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  24.84 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1815  hydroxypyruvate isomerase  27.46 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0352764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  23.53 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0766  xylose isomerase-like protein  28.57 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  33.62 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  26.74 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  33.62 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.8 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.72 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  22.4 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  30.95 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  30.95 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  30.95 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  28.83 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.52 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.37 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  30.34 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  28.42 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4691  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.67 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  24.71 
 
 		 338 aa  42.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  26.04 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  28.7 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  29.21 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  29.21 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  29.21 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  29.21 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  29.21 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  29.21 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.38 
 
 		 256 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  25.42 
 
 		 259 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>