74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2298 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 296 aa  603  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  67.04 
 
 		 289 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  54.58 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.2 
 
 		 278 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.89 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3527  xylose isomerase domain-containing protein  47.41 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  47.08 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  43.75 
 
 		 280 aa  231  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  42.86 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  44.7 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2021  petrobactin biosynthesis protein AsbF  44.7 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84806e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  44.7 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  44.7 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  44.7 
 
 		 280 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.81 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28960  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.81 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  25.85 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3434  xylose isomerase domain-containing protein  34.09 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0916  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.7 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5751  xylose isomerase domain-containing protein  27.88 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  28.77 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.32 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2411  xylose isomerase domain-containing protein  28.82 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1040  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.99 
 
 		 250 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1781  xylose isomerase domain-containing protein  25.59 
 
 		 347 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  25.86 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  27.16 
 
 		 338 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.66 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.76 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.71 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  27.57 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2266  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.88 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00648615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  22.78 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.88 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  23.35 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0413  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  28.19 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  25.46 
 
 		 644 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0344  AP endonuclease  31.25 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  32.93 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  27.92 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  24.11 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.43 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.97 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  27.52 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1554  putative isomerase  30.92 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  0.610325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 699 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.26 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 699 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.17 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  21.31 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.9 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.04 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.95 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.87 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  normal  0.0990251 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3582  xylose isomerase domain-containing protein  26.01 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.26 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2917  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.51 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  36 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  27.64 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  33.33 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4616  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.45 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  27.62 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1134  xylose isomerase domain-containing protein  32.26 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.155957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.77 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  26.74 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.3 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  25.96 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  34.83 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  29.15 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5294  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.07 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  23.3 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  28.43 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>