38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0501 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.74 
 
 		 285 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  47.22 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  43.06 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4521  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  34.93 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.44 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  23.78 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.32 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.54 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  31.41 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.82 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  0.2091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.16 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0182  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.05 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000874694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.44 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0883  xylose isomerase domain-containing protein  32.41 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  28.04 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28960  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.82 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.38 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.88 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  26.88 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  28.07 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  26.03 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1941  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.56 
 
 		 148 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3101  xylose isomerase domain-containing protein  29.01 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4227  xylose isomerase domain-containing protein  30 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.220336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1917  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.56 
 
 		 148 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2144  hypothetical protein  24.56 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  22.48 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.69 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.8 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.88 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2110  hypothetical protein  24.56 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  36 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1962  hypothetical protein  24.56 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.370718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  29.69 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1707  hypothetical protein  25.16 
 
 		 351 aa  42.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1444  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.68 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.19 
 
 		 265 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>